癌癥無(wú)創(chuàng)早期檢測(cè)技術(shù)取得新突破

　　每年全世界有超過(guò)1400萬(wàn)患者被診斷患上癌癥，其中大多數(shù)患者在確診時(shí)腫瘤已經(jīng)處于晚期或已經(jīng)擴(kuò)散。這時(shí)無(wú)論是手術(shù)還是藥物治療的效果都不佳。如果可以提早診斷，就有望提高癌癥生存率。本文威正翔禹/締一生物為您分析癌癥無(wú)創(chuàng)早期檢測(cè)技術(shù)取得新突破。

　　基于分析血液循環(huán)細(xì)胞DNA（cell-free DNA，cfDNA）的液體活檢（liquid biopsy）正在逐漸成為新一代癌癥的診斷方法。該技術(shù)的原理是癌癥患者的cfDNA中含有腫瘤細(xì)胞釋放的循環(huán)腫瘤DNA（circulating tumor DNA, ctDNA）。與高通量測(cè)序技術(shù)（NGS）和先進(jìn)算法相結(jié)合，研究人員已經(jīng)能夠通過(guò)ctDNA檢測(cè)確定腫瘤中的基因變異。但是這一手段目前大多被用于分析晚期癌癥患者的腫瘤。早期腫瘤釋放到血液中的ctDNA片段數(shù)目非常稀少，對(duì)液體活檢技術(shù)的應(yīng)用產(chǎn)生限制。

　　近期，約翰霍普金斯大學(xué)（Johns Hopkins University）醫(yī)學(xué)院的研究人員開發(fā)出一種稱為靶向錯(cuò)誤矯正測(cè)序（targeted error correction sequencing, TEC-Seq） 的超級(jí)敏感的ctDNA檢測(cè)方法，有望解決癌癥無(wú)創(chuàng)早期檢測(cè)的難題。這項(xiàng)研究發(fā)表在近期的《Science Translational Medicine》雜志上。

　　TEC-seq 是基于腫瘤組織的檢測(cè)原理開發(fā)出的ctDNA的檢測(cè)方法。它對(duì)結(jié)直腸癌、乳腺癌、肺癌、卵巢癌等癌癥類型中最常出現(xiàn)58種致癌基因進(jìn)行深度測(cè)序和分析。這58個(gè)基因片段總長(zhǎng)只有80930個(gè)堿基對(duì)，但是測(cè)序深度達(dá)到30000X。除了深度測(cè)序以外，研究人員還對(duì)測(cè)序流程做出了一系列改進(jìn)來(lái)提高檢測(cè)的靈敏度。其中包括：優(yōu)化測(cè)序庫(kù)的生成和靶向片段的捕捉，通過(guò)加入少量外源條形碼（barcode）**化獨(dú)特ctDNA在測(cè)序庫(kù)中的呈現(xiàn)可能，以及在后期分析時(shí)過(guò)濾掉測(cè)序錯(cuò)誤和其它原因?qū)е禄蜃儺悺?/span>

　　研究人員首先使用TEC-seq對(duì)44名健康志愿者的血樣進(jìn)行了檢測(cè)。TEC-seq沒(méi)有在他們的ctDNA中發(fā)現(xiàn)上述58個(gè)致癌基因發(fā)生變異。通過(guò)將TEC-seq檢測(cè)結(jié)果與傳統(tǒng)測(cè)序檢測(cè)手段進(jìn)行比較，研究人員發(fā)現(xiàn)TEC-seq能夠避免很多傳統(tǒng)測(cè)序檢測(cè)中出現(xiàn)的假陽(yáng)性基因突變。

　　在早期癌癥患者中，研究人員檢測(cè)了194名乳腺癌（n=45）、結(jié)直腸癌（n=42）、肺癌（n=65）或卵巢癌（n=42）患者的血樣。這些患者尚未接受治療，其中大部分患者的腫瘤處于I期或II期。檢測(cè)結(jié)果表明，采用TEC-seq技術(shù)，在晚期癌癥患者中（III或IV期）， 超過(guò)3/4的患者被檢測(cè)出致癌基因突變。而在早期癌癥患者中（I或II期）這個(gè)比率為62％。

　　研究還發(fā)現(xiàn)，這些TEQ-seq發(fā)現(xiàn)的基因變異雖然有一部分是熱點(diǎn)突變（hotspots），但是仍然有很多變異出現(xiàn)在非熱點(diǎn)區(qū)域。如果只關(guān)注熱點(diǎn)突變，陽(yáng)性檢出率則只有56％。這一結(jié)果說(shuō)明對(duì)致癌基因進(jìn)行更全面的測(cè)序可以提高檢測(cè)靈敏度。

　　在接受檢測(cè)的194名患者中，有152名患者同時(shí)提供了血樣、腫瘤組織和正常組織樣本。研究人員用另一種靶向NGS檢測(cè)手段對(duì)這些組織中致癌基因上的基因變異進(jìn)行了檢測(cè)，希望能夠證明TEC-seq檢測(cè)發(fā)現(xiàn)的基因變異是否源于腫瘤組織。

　　研究結(jié)果證實(shí)，TEC-seq在血漿中發(fā)現(xiàn)的基因變異中有72％同樣出現(xiàn)在腫瘤組織中。對(duì)于III或IV期癌癥患者，這個(gè)比例增加到77％，而對(duì)早期癌癥患者來(lái)說(shuō)，這個(gè)比例下降到68％。研究人員認(rèn)為，患者腫瘤組織的異質(zhì)性（heterogeneity）可能是造成血漿中發(fā)現(xiàn)的基因變異不能在腫瘤組織樣本中重現(xiàn)的原因。為此，他們?cè)谟行┗颊呱砩系牟煌课猾@取腫瘤組織進(jìn)行分析，研究結(jié)果表明血漿中發(fā)現(xiàn)的基因變異在某些患者身上只在部分次級(jí)腫瘤樣本中出現(xiàn)。

　　這些結(jié)果綜合起來(lái)表明， TEC-seq檢測(cè)有望用于無(wú)癥狀的患者進(jìn)行癌癥早期篩查，從而提高發(fā)現(xiàn)早期診斷。這對(duì)挽救癌癥患者的生命至關(guān)重要。

　　“如果能夠提前檢測(cè)出腫瘤的存在，我們拯救患者生命的機(jī)會(huì)將大大增加，”這項(xiàng)研究的資深作者，約翰霍普金斯大學(xué)Sidney Kimmel癌癥中心癌癥生物學(xué)的聯(lián)合主任 Victor Velculescu博士說(shuō)。

　　研究人員將進(jìn)一步在更大的患者群中驗(yàn)證這一檢測(cè)方法的效果，同時(shí)他們希望能夠進(jìn)一步優(yōu)化TEC-seq的檢測(cè)方法，提高這一檢測(cè)的靈敏度和準(zhǔn)確性。

       綜上所述，您是不是已經(jīng)對(duì)癌癥無(wú)創(chuàng)早期檢測(cè)技術(shù)取得新突破，有所了解。如果還有其他疑問(wèn)，請(qǐng)咨詢威正翔禹/締一生物資深專家免費(fèi)熱線：400-166-8600。