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m6A甲基化在免疫系統(tǒng)中的新發(fā)現(xiàn)

2022-01-28 14:26來源:威正翔禹|締一生物

文獻速讀

大家晚上好!

本期的文獻速讀

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近期關(guān)于表觀遺傳的一項研究

在此之前

我們先來溫習(xí)兩個專有名詞


自然殺傷細胞(natural killer cell,NK):


是機體重要的免疫細胞,不僅與抗腫瘤、抗病毒感染和免疫調(diào)節(jié)有關(guān),而且在某些情況下參與超敏反應(yīng)和自身免疫性疾病的發(fā)生。一般認為NK細胞直接從骨髓中衍生,其發(fā)育成熟依賴于骨髓的微環(huán)境。NK細胞的殺傷活性無MHC限制,不依賴抗體。

m6A甲基化修飾:


甲基化,是指從活性甲基化合物上將甲基催化轉(zhuǎn)移到其他化合物的過程,可形成各種甲基化合物,或是對某些蛋白質(zhì)或核酸等進行化學(xué)修飾形成甲基化產(chǎn)物。


N6-腺苷酸甲基化(m6A)是mRNA最常見的內(nèi)部修飾之一。通俗點講,當(dāng)腺苷酸的第六位N處發(fā)生甲基化時,就是我們所說的m6A。RNA的m6A甲基化一共有大三類酶參與:


甲基化轉(zhuǎn)移酶(Writers)

去甲基化酶(Erasers)

甲基化閱讀蛋白(Readers)


m6A甲基化修飾調(diào)節(jié)mRNA的剪接、翻譯和穩(wěn)定性,從而影響細胞的分化、增殖和凋亡。11.jpg

m6A甲基化與NK細胞的關(guān)系


近年來,越來越多的科學(xué)家將目光投向免疫系統(tǒng)中,m6A甲基化修飾的作用。但是,該甲基化對NK細胞的影響和調(diào)控卻尚不清楚。


近日,有科研人員對此進行了研究。


研究結(jié)果表明:


m6A“writer”METTL3在腫瘤浸潤的NK細胞中的表達下降,并且METTL3的蛋白表達水平與NK細胞中的效應(yīng)分子呈正相關(guān)。


NK細胞中METTL3缺失會改變NK細胞的穩(wěn)態(tài),抑制NK細胞在腫瘤微環(huán)境中的浸潤和功能,導(dǎo)致小鼠腫瘤發(fā)展加速,生存期縮短。


編碼SHP-2的基因經(jīng)過m6A修飾,其蛋白在METTL3缺失的NK細胞中表達減少。SHP-2活性的降低使NK細胞對IL-15的反應(yīng)降低,這與mettl3缺失NK細胞中AKT和MAPK信號通路激活的抑制有關(guān)。


這些結(jié)果表明,m6A甲基化保護了NK細胞的穩(wěn)態(tài)和腫瘤免疫監(jiān)控功能

實驗小結(jié)



該研究涉及到多個實驗,小鼠模型、細胞分離培養(yǎng)、細胞系構(gòu)建、細胞純化、甲基化測定、免疫組化、ELISA、RT-qPCR、免疫印跡,mRNA-seq等。


其中細胞培養(yǎng)是基礎(chǔ),RT-qPCR也是關(guān)鍵步驟之一。


細胞的培養(yǎng)離不開血清的支持,優(yōu)質(zhì)的血清在為細胞提供充足營養(yǎng)的同時,又可以**程度地減少外源的干擾,例如內(nèi)毒素等對細胞有影響的物質(zhì)。


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而像qPCR這樣精細的實驗,DNA污染很難徹底清除。即使只有一個污染的DNA分子被檢測到,也會使整個PCR檢測過程出現(xiàn)誤差。


為確保PCR試驗數(shù)據(jù)準(zhǔn)確,預(yù)防DNA或RNA交叉污染,PCR實驗室大多會常備DNA/RNA污染清除劑。


德國Minerva Biolabs PCR Clean?:


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