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Science:人類全蛋白質(zhì)組細(xì)胞內(nèi)分布圖首繪完成

2017-05-18 09:46

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  在一項(xiàng)新的研究中,對(duì)人細(xì)胞中的蛋白是如何分布的首個(gè)分析結(jié)果揭示出大部分人蛋白能夠在一個(gè)給定的細(xì)胞中的一個(gè)以上位置發(fā)現(xiàn)到。利用位于瑞典的細(xì)胞圖譜(Cell Atlas),研究人員研究了人蛋白質(zhì)組(對(duì)應(yīng)著絕大多數(shù)蛋白編碼基因)的空間分布,而且他們史無前例詳細(xì)地描述了蛋白在多個(gè)細(xì)胞器和細(xì)胞亞結(jié)構(gòu)中的分布。相關(guān)研究結(jié)果于2017年5月11日在線發(fā)表在Science期刊上,論文標(biāo)題為“A subcellular map of the human proteome”。


  在一個(gè)細(xì)胞中,細(xì)胞器形成一個(gè)封閉的空間。在這個(gè)空間中發(fā)生的化學(xué)反應(yīng)完成細(xì)胞中的特定功能。鑒于這些功能與一組特定的蛋白緊密地關(guān)聯(lián)在一起,了解人蛋白質(zhì)組的亞細(xì)胞定位是理解人細(xì)胞的功能和內(nèi)在機(jī)制的關(guān)鍵知識(shí)。


  這項(xiàng)研究是由瑞典皇家理工學(xué)院副教授Emma Lundberg領(lǐng)導(dǎo)的。Lundberg及其團(tuán)隊(duì)產(chǎn)生了30多萬張圖片來系統(tǒng)性地確定人蛋白在體外培養(yǎng)的細(xì)胞系中的空間分布,并且在單細(xì)胞分辨率上將它們定位到細(xì)胞區(qū)域和亞結(jié)構(gòu)中。


  這種細(xì)胞圖譜是人類蛋白圖譜(Human Protein Atlas)方案10多年研討的成果,它是在2016年12月建議的。這項(xiàng)新的研討具體地分析了這幾十萬張圖像。這些圖像是作為一項(xiàng)國際合作舉動(dòng)的一部分發(fā)生的。這個(gè)國際合作舉動(dòng)也包含來自我國、韓國、印度、丹麥和德國的研討團(tuán)隊(duì)。


  瑞典皇家理工學(xué)院教授、人類蛋白圖譜主任Mathias Uhlen說,“僅通過研究人體最小的功能單元(即細(xì)胞),我們才能夠充分地理解人體生物學(xué)功能。這種細(xì)胞圖譜給研究人員提供新的知識(shí)而有助在功能上解釋單個(gè)蛋白和它們?cè)谌梭w生物學(xué)功能和疾病中的作用?!?/span>


  這些研究人員將由13,993種抗體靶向的總共12,003種蛋白定位到30個(gè)細(xì)胞區(qū)室和亞結(jié)構(gòu)中的一個(gè)或多個(gè),此外,他們還詳述了13個(gè)主要細(xì)胞器的蛋白質(zhì)組。具有**蛋白質(zhì)組的細(xì)胞器是細(xì)胞核(有6,930種蛋白)及其亞結(jié)構(gòu)(如核小體和核小斑點(diǎn)),和細(xì)胞質(zhì)(有4,279種蛋白)。


  這篇發(fā)表的論文也包括英國劍橋大學(xué)劍橋蛋白組學(xué)中心Kathryn Lilley開展的一項(xiàng)比較研究:能夠利用一種基于質(zhì)譜的替代性映射策略驗(yàn)證這種基于抗體的免疫熒光顯微分析結(jié)果。


  令人重視的是,大概一半的蛋白在一個(gè)以上的細(xì)胞區(qū)室中發(fā)現(xiàn)到,這提醒出一群一樣的蛋白存在于細(xì)胞中的功能上不相關(guān)的有些。這一發(fā)現(xiàn)進(jìn)一步闡明了細(xì)胞的復(fù)雜性。


  這種細(xì)胞圖譜是一種敞開存取的資源,可以被全世界的研究人員用來研究感興趣的蛋白或細(xì)胞器。Lundberg說,“這種細(xì)胞圖譜能夠允許開展系統(tǒng)生物學(xué)和細(xì)胞建模應(yīng)用,而且它也是圖像模式識(shí)別中的機(jī)器學(xué)習(xí)應(yīng)用的一種高度有價(jià)值的資源。”


  威正翔禹生物(Vian-Saga)始終專注于細(xì)胞培養(yǎng),制藥,疫苗生產(chǎn),生物醫(yī)療,微生物培養(yǎng)等領(lǐng)域。為國內(nèi)科研生產(chǎn)用戶提供:細(xì)胞培養(yǎng)用進(jìn)口血清,培養(yǎng)基,支原體檢測祛除試劑,微生物培養(yǎng)基和檢測試劑,疫苗質(zhì)控試劑,蛋白穩(wěn)定劑,國際標(biāo)準(zhǔn)級(jí)增鮮劑,蛋白胨和蛋白水解物等原料


  來源:生物谷