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新技術(shù)能夠準(zhǔn)確指征腸道微生物的起源

2019-06-13 15:33來源：生物谷


加州大學(xué)洛杉磯分校領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)已經(jīng)開發(fā)出一種更快，更準(zhǔn)確的方法來確定人體中許多細(xì)菌的來源。從廣義上講，該工具可以推斷出任何微生物組的起源。


與需要數(shù)天或數(shù)周的工具相比，新的計(jì)算工具“FEAST”可以在短短幾個小時內(nèi)分析大量遺傳信息。該軟件程序可用于醫(yī)療保健，公共衛(wèi)生，環(huán)境研究和農(nóng)業(yè)。該研究在線發(fā)表在《Nature Methods》上。


微生物組通常包含數(shù)百至數(shù)千種微生物物種。人類的消化道、湖泊和河流，到處都可以找到微生物的存在。了解這些生物來自何處以及這些群落如何形成可以讓科學(xué)家更詳細(xì)地了解影響人類健康的微觀生態(tài)過程。對此，研究人員開發(fā)了新型程序，為醫(yī)生和科學(xué)家提供了一種更有效的工具來研究微生物的組成。

有了這些信息，醫(yī)生將能夠通過簡單地分析他們的微生物組來區(qū)分健康人和患有特定疾病的人?？茖W(xué)家可以使用該工具檢測水資源或食品供應(yīng)鏈中的污染。


“微生物組已經(jīng)與人體生理學(xué)和健康的許多方面聯(lián)系在一起，但我們正處于了解微生物組的臨床意義的早期階段，”作者說道：“微生物組數(shù)據(jù)得到了前所未有的擴(kuò)展，這使我們對微生物生命的各種功能和分布的了解迅速增加，盡管如此，如此龐大而復(fù)雜的數(shù)據(jù)集卻帶來了統(tǒng)計(jì)和計(jì)算方面的難題?！?/span>


研究人員表示，與其他源跟蹤工具相比，F(xiàn)EAST的速度提高了300倍，并且更準(zhǔn)確。此外，目前的工具只能分析較小的數(shù)據(jù)集，或僅針對被認(rèn)為是有害污染物的特定微生物。研究人員說，這種新工具可以處理更大的數(shù)據(jù)集，并提供更完整的微生物信息以及來源。