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科學(xué)家有望利用大數(shù)據(jù)分析來預(yù)測癌癥患者對免疫療法的反應(yīng)

2018-08-14 14:55來源:生物谷

如今在大數(shù)據(jù)時(shí)代,癌癥研究人員開始尋找多種新方法來監(jiān)測癌癥免疫療法的有效性;近日,一項(xiàng)刊登在國際雜志Cancer Immunology Research上的研究報(bào)告中,來自約翰霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員通過研究開發(fā)出了一種利用生物信息學(xué)的新方法,該方法或能作為一種新型工具幫助確定患者的免疫系統(tǒng)如何對癌癥免疫療法產(chǎn)生反應(yīng),以及如何有效識別機(jī)體自身的腫瘤。


研究者Kellie Smith博士表示,我們希望能夠得到足夠的數(shù)據(jù),通過利用一種名為MANAFEST的技術(shù)來幫助臨床研究人員確定癌癥患者的**治療方案;一旦某個(gè)人被診斷為癌癥,我們就希望能利用該技術(shù)為其制定**的治療手段,以前研究人員并沒有開發(fā)出MANAFEST技術(shù),在過去幾年里,研究人員通過對這項(xiàng)技術(shù)進(jìn)行不斷改善,如今其能夠?qū)Χ囗?xiàng)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析來幫助有效治療癌癥患者。


突變相關(guān)的新生抗原(MANAs,Mutation-associated neoantigens)常常能夠作為抗腫瘤T細(xì)胞免疫力的作用靶點(diǎn),然而目前研究人員希望能夠通過研究闡明T細(xì)胞如何識別癌癥患者機(jī)體中的MANAs。為了提高生物信息學(xué)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性,科學(xué)家們改變了采集培養(yǎng)基的方式,開發(fā)出了一種名為FEST分析的新技術(shù)(Functional Expansion of Specific T-cells,特殊T細(xì)胞的功能性擴(kuò)展技術(shù))。


研究者表示,這種組合性的信息能被用來開發(fā)一種數(shù)據(jù)庫,幫助研究人員發(fā)現(xiàn)哪些類型的免疫療法相關(guān)反應(yīng)與臨床效益直接相關(guān),從而能改善癌癥患者的療法效益;在接受免疫療法的患者機(jī)體中的血液、腫瘤和正常組織中,F(xiàn)EST方法能夠?qū)iT用來檢測特異性的MANA序列,同時(shí)這種技術(shù)還能用來預(yù)測多種類型癌癥患者對免疫療法所產(chǎn)生的反應(yīng)。


最后研究者指出,這是他們目前使用的**代FEST技術(shù),后期他們希望能夠收集更多數(shù)據(jù)建立更大規(guī)模的數(shù)據(jù)庫,幫助監(jiān)測癌癥患者對疾病所產(chǎn)生的免疫反應(yīng)的強(qiáng)度。